战国末期，荆轲刺秦失败牺牲。天下第一剑客盖聂受荆轲所托，护送荆轲之子荆天明躲避秦王追杀。在秦国边境残月谷，盖聂一人击退三百秦国铁骑，秦王震怒，命丞相李斯务必铲除两人。李斯在阴阳家东皇太一的指引下寻访到了盖聂的同门兄弟卫庄，卫庄剑术超群却始终居于盖聂之下，为夺得天下第一剑的名号，卫庄答应了李斯的要求，殊不知自己已经掉入了东皇太一的圈套。
天明在出生之时，身上便被阴阳家偷偷种下“乾元玉煞”，“乾元玉煞”关系到一个巨大阴谋。那么乾元玉煞是什么?《秦时明月》乾元玉煞的阴谋是什么?阴阳家为什么要在天明身上种乾元玉煞。
阴阳家为什么要在天明身上种乾元玉煞原因
逃亡路上，盖聂与天明结识了墨家众高手，以及楚国大将后人项少羽和墨家少女高月，一行人在命运的引领下进入被誉为世间最后一片净土的墨家机关城。机关城隐匿于绝岭雄峰之间，集结了墨家深厚的智慧，是天下所有反秦势力最后的堡垒，它也是墨家弟子最后的避难所。
唐人影视拿到版权后进行改编，由于动漫《秦时明月》来自于温世仁原著小说，跟原著小说内容很不一样，所以回到原著小说的话较传统;但如果按照动漫去拍也会很奇怪，比如盖聂在动漫里可以一直不讲话，台词非常少，但真人版如果不讲话会很沉闷。另外，动画每集是二十几分钟，改编动漫前四部要做成一部几十集的电视剧，动画内容是不够拍的，所以需要往里填许多原创的东西。
对于原创的部分，因为有网站组织了一个“朝阳与落霞”的读书会，二月河与孙皓晖对谈秦朝与清朝，所以给了制作方一个启发，想把中国的历史文化通过电视剧普及到青少年的层面，要既能吸引到青少年，又要在历史层面上很考究。因此制作方为电视剧《秦时明月》做了一年多的资料搜集，参考孙皓晖老师的小说《大秦帝国》和司马迁的纪传体通史《史记》等很多资料，再加上故事发生在秦朝，于是制作组注意不能偏离秦朝历史太远，把虚构的主人公融入到真实的历史环境里面。
剧本做了一年多，为了将历史、动漫、武侠较好地结合起来，前后一共改了三次。就这部剧的整体风格来讲，虚构人物的语言风格是符合现代人的审美观的，而像秦王、赵高这样历史人物的台词是比较考究，另外像墨家、阴阳家会在语言上体现他们的思想。
